上海市亭新中学原有亭东和新民两所分校，分别于1989年和1997年撤点，并入亭新中学。1992年起，亭新中学为金山县实施学校内部管理体制纵合改革第二批试点单位。1997年，学校实施市政府薄弱学校更新改造工程。 几经改造后，至2006学年，学校占地面积达到了17614平方米，校舍面积达到了10182平方米，绿化面积达到了11750平方米。