学校办学成绩突出，中考成绩稳步提高，连续几年的中考成绩在全区普通校中名列前茅，更有以张峰、杨博远等同学为代表的优秀毕业生，以优异的成绩考入人大附中、北京四中、二中等市区示范高中，有更多的同学升入自己理想的学校，骄人的成绩不仅赢得了学生和家长的的满意，更得到了社会的认可。2000年至2011年，学校多次被教委、教工委评为教育科研先进集体、课外教育先进集体、法制教育先进集体和“爱科学月”活动先进集体、先进党支部； 2002年北京市教委批准北京市国子监中学成立英语实验班； 2003年被评为全国“中华古诗文经典诵读工程特色校； 2003年被北京市知识产权局和东城区教委命名为“知识产权示范校”； 2004年10月被评为“北京市家庭教育先进集体”； 2005年获中央教科所国家级科研工作先进集体； 2006年北京市中小学生艺术节获小合唱一等奖； 2007年被评为北京市语言文字规范示范校。 2002年中考取得全区第八的优异成绩； 2003年中考北京市国子监中学是唯一一所及格率超区平均水平的普通校； 2004年中考取得全区第十一； 2005年中考取得全区第十三； 2006 年中考取得全区第十二。2007、2008年中考取得全区第八 2009年中考取得全区第九。