密云三中办学目标是：全面贯彻党的教育方针，深化素质教育实施；教学设施完善达标，建设一支高素质的教职工队伍，实现教学手段现代化，实现学校管理科学规范高效率，教育教学高质量。办学思想是：依法治校，以德治校；以高素质的教师队伍建设为核心，实施科学规范化管理，形成教职工队伍强大的凝聚力；科研兴教，改革课堂教学，提高课堂效益，突出学生实践与创新精神的培养；创设良好的育人环境，注重科学与人文精神的结合；推进现代化教育技术实施；学校服务社会，依托社会，保持开放性；高标准完成初中阶段教育任务，培养高素质的初中毕业生。概括为：“师生为本、重在发展、现代化、高素质。”