南开中学课外活动丰富，开设了众多的学生社团和课外活动小组。学校目前有约三十个学生社团，涉及文学、科技、艺体、社会实践、志愿服务等多个领域，既丰富了学生的课余生活又为历经沧桑的校园带来勃勃生机。

以南开融侨校区为例，目前有合唱队、广播站、动漫社、女子健美操等30多个课外活动小组，并配有专门的辅导教师。